PCR検査、めちゃくちゃ手間がかかる検査だった…たぶん加藤くんも検査単位を勘違いしてると思う！謝ろう！ [322795904]

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◆PCRにかかる時間に対する認識のズレ
もし正しく「PCR検査全体でどのくらいの時間かかるの？」と聞かれれば、

「サンプルによって変わる。サンプル調製を省いて、検査サンプル液からダイレクトにPCRやればかなり短時間だし、
逆に下処理が面倒なサンプルだと数時間余命にかかるし、RT-PCRだったらRT-反応の分だけ１時間くらい余計にかかる。なので半日から１日は必要」

という答え方になります。

◆ 感染注意！RNA抽出
「1.検体の採取と保存」はとりあえずあと回しにして、「2.RNAの抽出」については、市販のキットを用いるよう指示されています。
時間は多分30分くらいあればいいかと思います。サンプル数が多ければ1時間くらいは必要ですが、この時間はマスコミや政治家のいう「PCR時間」には含まれないことが多いです。

実験って実は意外と飛沫が発生するし、セーフティキャビネット使ってても、遠心かけたりするときにはそこから出さざるを得ないし、
しっかりと訓練されてないと、無意識に汚染手袋でそこらへん触りまくって、手袋外したあとに汚染場所を触る。

「PCRくらい簡単にできるだろ」などと無責任に言う人、あんたなら確実に感染するからな。感染するからな。

自分がやるのをイメージすると、このステップはそこそこ恐怖を感じます。
恐怖をイメージできない人は、何が怖いのかよくわからないうちに、かなり高い確率で感染します。感染した挙げ句、RNAは分解されてなくなってしまいます。

◆ いよいよPCRです
DNAができましたので、いよいよPCRです。

ここで重大な事実が発覚です。察しのいい人はすでにお気づきでしょうが、対象とする遺伝子が２種類あります。しかも2段階（Nested、入れ子）PCRです。

２種類の遺伝子に対して、それぞれ２回PCRします。1サンプルで4回分のPCRです。２遺伝子なのはいいんですよ、並行してやれますから。
Nested PCRはPCRしたあと、そのPCR産物に対してさらにPCRをするので、２回分の時間がかかります。雲行きが怪しくなってまいりました。

時間は、いい機械なら速いですが古い機械なら遅いです。PCR１回で２時間から２時間半くらい、Nestedなので２倍の４時間から５時間。
試薬を混ぜる時間を考えると１時間プラス。PCR数は４倍ですからサンプル数が多ければ下手をすると２時間くらい必要です。

結局このステップで５～６時間くらいです。

◆ 感染疑い者１人に対するサンプル数

感染疑い者１人で、咽頭拭い液と下気道由来検体の最低２サンプルです。痰が取れない人は咽頭拭いだけの１サンプルですが、
肺炎まで行っていれば２サンプル確定です。さらに、血清、便、尿、全血とオプションも豊富です。つまり、感染疑い人数×２くらいのウイルスサンプル数になります。

そして、陽性にしろ陰性にしろ、複数回検査しているので、さらに２～３倍です。陰性確認だって１回陰性が出たあと、
２週間とか一定期間おいたあとさらに陰性になってやっと潔白証明、無罪放免です。感染確認者は３回以上実施していることでしょう。

マスコミと政治家のいう検査可能数は検査人数だとしたら、ウイルスサンプルは２～３サンプル×２～３回で４～９倍、PCR数はさらに４～５倍ですよ。被検査人数×20～30がPCR数ということになります。

はい、「PCRくらいもっとできるだろ」とか言っていた皆さん、わたしと一緒に謝りましょう。
https://shinjukuacc.com/20200224-01/